همزمان با راه اندازی مراکز تحقیقاتی دانشگاه در سال 1384، دفتر امور مراکز تحقیقاتی به منظور پیگیری راه اندازی، پشتیبانی، نظارت، ارزیابی عملکرد و تبدیل وضعیت مراکز تحقیقاتی زیر نظر معاونت پژوهشی دانشگاه آغاز به کار نمود. بر اساس برنامه ای 5 ساله مقرر گردید واحدهای پژوهشی فعال در راستای سیاستهای علمی کشور مورد توجه قرار گرفته و در قالب مراکز تحقیقاتی مستقل ادامه فعالیت دهند. در همین راستا و به منظور تحقق اهداف چشمانداز 1404 جمهوري اسلامي ايران - نقشه جامع علمي كشور - ماموريت گرايي مراكز پژوهشي و به منظور هدفمند و تقاضا محور نمودن تحقيقات در دانشگاه و تمركز بر جنبههاي خاص و استراتژيك ، واحدهای پژوهشی دانشگاه تاسیس گردید. درحال حاضر 3 پژوهشکده، 6 مرکز تحقیقاتی و 4 گروه پژوهشی در دانشگاه در حال فعالیت می باشند.